Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF3P57682 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms