Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52P55327 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52P55327 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52P55327 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52P55327 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52P55327 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52P55327 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52P55327 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52P55327 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52P55327 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52P55327 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms