Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRISP1P54107 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms