Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSK3BP49841 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSK3BP49841 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSK3BP49841 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSK3BP49841 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSK3BP49841 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSK3BP49841 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSK3BP49841 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSK3BP49841 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GSK3BP49841 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms