Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FDFT1P37268 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms