Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms