Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAP3P28838 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAP3P28838 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAP3P28838 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAP3P28838 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAP3P28838 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAP3P28838 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAP3P28838 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAP3P28838 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms