Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA3P26006 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms