Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLDCP23378 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLDCP23378 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLDCP23378 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLDCP23378 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLDCP23378 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLDCP23378 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLDCP23378 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLDCP23378 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLDCP23378 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLDCP23378 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLDCP23378 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLDCP23378 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLDCP23378 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms