Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL2P19875 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CXCL2P19875 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms