Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms