Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3P10147 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3P10147 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3P10147 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3P10147 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3P10147 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3P10147 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3P10147 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3P10147 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL3P10147 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms