Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms