Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF888P0CJ79 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF888P0CJ79 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms