Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NGFRP08138 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms