Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYNP07948 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYNP07948 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYNP07948 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYNP07948 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYNP07948 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYNP07948 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYNP07948 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LYNP07948 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYNP07948 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYNP07948 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYNP07948 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYNP07948 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYNP07948 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYNP07948 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms