Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC1P02654 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms