Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOEP02649 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOEP02649 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOEP02649 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOEP02649 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms