Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms