Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-HP01893 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms