Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SURF6O75683 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SURF6O75683 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SURF6O75683 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SURF6O75683 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SURF6O75683 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms