Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX5O60225 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms