Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms