Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN4O14817 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN4O14817 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN4O14817 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN4O14817 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN4O14817 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN4O14817 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN4O14817 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN4O14817 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN4O14817 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN4O14817 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN4O14817 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN4O14817 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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