Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM25AB3EWG3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms