Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACOD1A6NK06 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms