Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms