Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms