Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRBQ9Y5M8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms