Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms