Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINLQ9Y2I6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NINLQ9Y2I6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms