Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC4Q9Y296 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms