Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYH13Q9UKX3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms