Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms