Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD2Q9UBB5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms