Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms