Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RDH8Q9NYR8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RDH8Q9NYR8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RDH8Q9NYR8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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