Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms