Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PARVAQ9NVD7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms