Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ECHDC1Q9NTX5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC1Q9NTX5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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