Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31BQ9NQW1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms