Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms