Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00597Q9H2U6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00597Q9H2U6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms