Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms