Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms