Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BCO2Q9BYV7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms