Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NIFKQ9BYG3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NIFKQ9BYG3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms