Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDHR2Q9BYE9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDHR2Q9BYE9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms