Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSBP3Q9BWW4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP3Q9BWW4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP3Q9BWW4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP3Q9BWW4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP3Q9BWW4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP3Q9BWW4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP3Q9BWW4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP3Q9BWW4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP3Q9BWW4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms