Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNDC11Q9BVV2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms